优质的有机肥是蔬菜优质高产的基础，而现在菜农施用的有机肥，大都是买来的商品有机肥，质量普遍较差，有些甚至掺杂了城市污泥、生活垃圾等，根本就达不到有机质含量的标准。即使是一些买来的鸡粪，也有不少掺杂泥土，或被一些不法商贩掺入火碱(用于增加体积)，这些劣质有机肥施入土壤后，效果可想而知。因此，生产中一定要选用优质的有机肥，选用商品有机肥时好选用正规大厂生产的。
 
1.严格控制施肥量
一般情况下，每亩菜地以施入纯鸡粪15-20立方米、稻壳粪35-40立方米为宜。茄果类蔬菜需肥量较大，可取其上限;叶菜类需肥量稍小一些，可取其下限。
2.配合生物肥施用效果好
有机肥无论基施和冲施，好配合生物肥施用。因为有机肥在与生物肥配合施用后，生物肥中的生物菌能加速有机肥中有机质的分解，使其更有利于作物吸收，同时能将有机肥中的一些有害物质分解转化，避免其对蔬菜造成伤害。
 
农业生产中，农民普遍将有机肥与化肥搭配施用。然而，土肥专家指出，有机肥可与氮肥配施，但不宜和磷肥配施。农民要走出有机肥与磷肥配施的误区。
施有机肥后再施氮肥，作物可大幅增产;若施有机肥后再施磷肥，增产效果则大幅下降，而且有机肥用量愈高，降幅愈大。以上情况不但在试验中得到证明，在多次生产实践中也得到证实。因此，有机肥和氮肥可以配施，但要和磷肥分开施。